甲酸乙酯具有麻醉和刺激作用，人吸入甲酸乙酯會引起一系列的不良反應，頭痛、惡心、乃至是損失神志。甲酸乙酯在新西蘭是被禁止運用的殺蟲劑，可是其殺蟲作用良好，可是毒性較大，殘留高。甲酸乙酯用于新鮮植物的殺蟲劑毒性過大，可是假如用于儲糧熏蒸劑相對溴甲烷來講，毒性要小一些，國際上已經在研討儲糧熏蒸劑溴甲烷的替代品，假如能夠想辦法將甲酸乙酯的毒性下降，就能夠作為儲糧熏蒸劑廣泛運用。所以農藥廠就開始研討怎樣才能減小甲酸乙酯的毒性，這樣以甲酸乙酯為質料制作了許多許多其他的藥物。